Esto es muy fácil hacemos así :
$ lein new app nombreDeLaApp
Generating a project called nombreDeLaApp based on the 'app' template.
Como ustedes pueden ver utilice el template app, pero que es eso de los templates? Bueno, leiningen provee un conjunto de template que permiten hacer proyectos con una estructura determinada.
Y si quieren ver los template acá dejo el link : https://clj-templates.com/
Y listo! Ahora si queremos correr la app hacemos :
$ cd nombreDeLaApp
$ lein run
Y listo!!!!